Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms