Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms