Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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