Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms