Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Slc8b1Q925Q3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Slc8b1Q925Q3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms