Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2afjQ8R1M2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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