Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Abcf3Q8K268 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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