Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms