Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mterf1aQ8CHZ9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms