Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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