Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms