Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samd4aQ8CBY1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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