Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms