Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms