Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms