Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms