Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms