Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms