Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms