Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CltbQ6IRU5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms