Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms