Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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