Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim28Q62318 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim28Q62318 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim28Q62318 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim28Q62318 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim28Q62318 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim28Q62318 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim28Q62318 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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