Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
BcanQ61361 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms