Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
JrkQ60976 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms