Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csnk2a1Q60737 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csnk2a1Q60737 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms