Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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