Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm27Q5SFM8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm27Q5SFM8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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