Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms