Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp19Q3UJD6 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms