Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms