Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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