Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms