Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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