Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms