Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc21bQ0HA38 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc21bQ0HA38 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc21bQ0HA38 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc21bQ0HA38 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc21bQ0HA38 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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