Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sh3bp2Q06649 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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