Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mc1rQ01727 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms