Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms