Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SeleQ00690 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms