Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms