Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme1P97371 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme1P97371 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms