Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SmsP97355 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SmsP97355 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms