Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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SgcgP82348 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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SgcgP82348 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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SgcgP82348 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcgP82348 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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