Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1P70338 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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