Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crnkl1P63154 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms