Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga11P61622 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itga11P61622 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms