Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms