Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LmnaP48678 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms