Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms